SIMULASI MOLECULAR DOCKING KONSTITUEN ASAM LEMAK IKAN GABUS (Channa striata) PADA FFAR4/GPR120
Abstrak
Kondisi diabetes melitus tipe 2 (DM Tipe 2) mempunyai tingkat sitokin pro inflamsi yang tinggi. FFAR4/GPR120 merupakan reseptor asam lemak bebas yang berperan dalam penurunan sitokin pro inflamasi. Penelitian ini dilakuakn dengan tujuan untuk memperkirakan interaksi konstituen asam lemak pada ikan gabus terhadap FFAR4. Struktur kristal protein FFAR4 dibuat menggunakan pemodelan homologi, senyawa uji digunakan menggunakan Marvin Sketch, BDS dan MVD digunakan untuk simulasi docking dan visualisasi. Melatonin receptor type 1B dengan nilai Seq Identity 26.69% dipilih sebagai template pada pemodelan homologi menhasilkan model FFAR4 (Ramachandran Favoured (91.67%)). Penelitian menunjukan DHA dengan rerank score -78,843 memiliki pengikatan terbaik diantara 2 asam lemak lainnya.
Kata kunci: Channa striata, DHA, asam lemak bebas, hiperglikemia